圣地亚哥废水样本分析项目因联邦资金削减停止

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自2021年2月以来,圣地亚哥流行病学与新冠健康研究项目(SEARCH)与加州大学圣地亚哥分校、斯克利普斯研究所以及拉迪儿童医院的基因组项目合作,利用先进的科学技术,对圣地亚哥县的三座不同污水处理厂收集的废水样本进行分析。

这项工作旨在估算区域内330万居民排放的病毒数量和类型。

最初的研究集中在新冠病毒上,但在2022年扩展至MPOX,并且研究人员正在探索利用相同的基因分析技术来检测流感、肝炎、麻疹及其他病原体。

然而,周一,研究人员收到通知,县公共卫生部门每年提供的大约40万美元的资金将停止,这标志着研究工作的结束。此次资金削减是因为美国疾病控制和预防中心(CDC)下属的“流行病学与实验室能力”项目的联邦公共卫生资金在全国范围内被削减。

尽管其他废水检测服务仍将可用,但圣地亚哥县的这一努力提供了有关社区病毒类型的更多信息。

加州大学圣地亚哥分校的孕产研究主任路易丝·劳伦特和斯克利普斯研究所传染病基因组学主任克里斯蒂安·安德森周一表示,资金的撤回迫使SEARCH停止运营。

劳伦特说:“我们会做最后一批,因为我们已经购买了试剂。”她指出,实验室每周送到的新样本交付已完成。

劳伦特表示,预计资金会耗尽,因为县计划将废水监测纳入其正在进行的运营清单中,包括需要特殊设备的新公共卫生实验室,该实验室预计将于明年5月在凯尔尼梅萨开放。

研究人员表示,他们预计将逐步将知识从这些多年来运行这种高技术服务的研究实验室转移给负责提供准确结果的县实验室。

“计划是,我们在八月底结束今年的合同,然后会有一个有序的过渡,他们将回来学习我们的整个过程。”劳伦特说。

她补充说,关键在于加州大学和县实验室在两者的设备上并行处理相同的废水样本,以确保结果一致。

“问题的一部分在于,这一切都是无序的,”劳伦特说。“在某一天得知你的合同在一周前结束,没有过渡时间,你被要求停止,这不是最高效的做法。”

县方对此表示同意。

“在理想情况下,县实验室会在加州大学仍在运行时启动其内部程序,以便将县数据与加州大学的数据进行等价比较,”县在一份电子邮件声明中表示。“实验室仍然可以独立启动一个完全功能的内部项目,但可能更难以比较数据。”

县的声明补充道,公共卫生服务部门正在“处理将历史样本从加州大学转移到新县实验室的后勤问题。”

安德森补充说,研究机构并不打算就此放弃县的努力,但在没有资助的情况下,能够完成的工作会受到限制。

“我们并不对县感到愤怒,因为我们知道他们并不想这样,”安德森说。“即使没有任何资金,我们仍会尽力帮助县建立起来。

“但是,明确来说,所有这一切都是由于来自联邦政府的要求,特别是这些资金的削减,而不是县本身。”

当被问及此事时,县表示,现有的废水检测合同“因联邦削减而暂停”。

“县仍然期待将该检测及相关调查程序转移到新实验室中,”声明中写道。“此外,废水SCAN和加州公共卫生部(CDPH)均提供地方检测。公共卫生服务感谢加州大学圣地亚哥分校和斯克利普斯所提供的服务,并期待继续保持密切关系。”

县方提到,无废水SCAN是一个全国性的废水分析项目,由斯坦福大学和亚特兰大的埃默里大学共同运营,并获得慈善资金支持。该项目没有显示也将停止的迹象。加州公共卫生部也定期发布新冠病毒的废水检测结果。

圣地亚哥的SEARCH项目与其他项目的不同之处在于,社区能够获取到更多的细节。

其他项目提供定期更新,关于废水样本中发现的病毒遗传物质的总量,这是早期发现社区新爆发的重要因素。

检测到的病毒总量激增通常与新变种的到来相对应,这种新变种可能传播迅速并导致许多新的感染。SEARCH进一步提供了使用基因测序来确定引起整体活动增加的病毒亚型。

安德森说:“了解这一点至关重要,因为并非所有变种的表现都是相同的,我们需要知道哪些变种正在传播,以便为将来的疫苗选择新的变种,重要的是,了解哪些变种可能对那些无法接种疫苗或无法产生自身免疫力的人逃避单克隆抗体的疗法。”